מכון "כנרת" למחקר קשרי חברה, ביטחון ושלום, הוקם כמכון למחקר וללימוד יחסי הגומלין בין החברה לבין הצבא , החברה וביטחון במדינת ישראל. המכון יוזם כנסים, ימי עיון ונותן חסות לפרסומים העוסקים בנושאים אלה בראיה רב תחומית והשוואתית. המכון מקדם עיון, דיון, מחקר ופרסום בהיבטים הכלכליים, החברתיים, התרבותיים, המדיניים האסטרטגיים, התקשורתיים ויחסי הגומלין שלהם עם נושאי הביטחון ובהשלכותיהם ה מעשיים של יחסים אלה.
מיקומה של מכללת כנרת מהווה בסיס ואבן שואבת למחקר, לימוד ודיון בנושאים גיאו-אסטרטגיים הייחודיים למרחב. מפגש הגבולות ישראל-סוריה-וירדן, מהווה כר נרחב למחקר ולדיון בנושאים מדיניים כלכליים וביטחוניים דוגמת הגבולות והסדרי השלום העתידיים. מקורות המים במרחב מהווים יעד לימודי ומחקרי ובסיס לשיתוף פעולה בין אזורי לעתיד.